當農產品經營者被暫時停止驗證時，驗證證書仍為有效，但農產品經營者將暫時無法使用產銷履歷農產品標章，或以產銷履歷農產品名義標示、販售、展示或廣告。
驗證機構通知農產品經營者暫時停止驗證時，會針對暫時停止驗證的事由，和農產品經營者協調以實地稽核或是資料補正等方式，釐清異常原因及矯正措施，如農產品經營者在期限內完成改正，可向驗證機構申請恢復驗證資格，如經驗證機構確認通過，即可恢復產銷履歷驗證資格。如屆期未完成改正，驗證機構將終止農產品經營者驗證資格。
